固體顆粒物質——空氣中的粉塵、流動相中的固體顆粒、樣品中的固體顆粒、泵和密封圈的磨損以及管路老化等都是固體顆粒物質的來源，眾多來源讓人防不勝防，特別是泵和密封圈的磨損更是讓人無處可逃，液相廠家也莫可奈何，保護柱可以防止此等固體顆粒物質的煩擾，保色譜柱無憂，畢竟保護柱可以反向高流速將固體顆粒物質沖下，而色譜柱不行。當然此類殺手用在線過濾器更好，簡單的計算一下成本就明白，一個篩板總比保護柱芯便宜吧。

pH超標——目前硅膠基質的色譜柱是主流，在市面上買到的98%以上都是硅膠基質的色譜柱，因為硅膠基質的色譜柱柱效高、質量穩定性好，以硅膠基質為主流確實無可厚非。但是，硅膠基質的色譜柱也有其脆弱之處，首先，硅膠在堿性條件下是容易被侵蝕、溶解的，所以pH應在7.0以內使用，此外，C18色譜柱的填料是在硅膠顆粒上鍵合上了C18長鏈，C18長鏈與硅膠顆粒是以Si-C鍵的形式連接的，Si-C鍵容易在pH<2的條件下斷裂。

因此硅膠基質的色譜柱通常須在強保留物質——成份復雜的樣品比如中藥，做中藥樣品的時候色譜柱使用壽命通常不會太長，縮短使用壽命的zui大的元兇就要數強保留物質了。每一次做中藥樣品的客戶發回色譜柱維護的時候，通常都會發現柱壓高的狀況，而且打開柱頭幾乎都會發現柱前端填料顏色或黑或黃，有時候深挖5mm也仍見顏色異常。對于色譜柱的維護而言5mm的深度已經是非常忌諱的了，需特別經驗豐富的人才敢挖這么深，一般不會超過2mm的。強保留物質也是防不勝防，因為這是樣品中自帶的成份，我們要么就在前處理上加上諸多耗錢耗力的程序，否則你毫無辦法，即使再號稱超長使用壽命的色譜柱也無法抵擋它的攻勢，畢竟強保留物質對所有品牌柱子的污染都是平等的。其實此類殺手是用保護柱的，一般的保護柱填料都有10mm長，比深挖5mm的辦法來處理色譜柱而言換個保護柱芯則要簡單省力得多。